Satrapi je rođena u Raštu , Iran. Odrasla je u Teheranu u iranskoj porodici srednje klase i pohađala je Lycée Razi na francuskom jeziku . Oba njena roditelja su bili politički aktivni i podržavali su marksističke ciljeve protiv monarhije posljednjeg šaha . Nakon Iranske revolucije koja se dogodila 1979. godine, oni su bili pod vlašću muslimanskih fundamentalista koji su preuzeli vlast.
Tokom svoje mladosti, Satrapi je bila izložena rastućoj brutalnosti različitih režima. Mnogi njeni porodični prijatelji bili su proganjani, uhapšeni, pa čak i ubijeni. Pronašla je heroja u svom stricu po ocu, Anoošu, koji je bio politički zatvorenik i neko vrijeme je živio u egzilu u Sovjetskom Savezu . Mlada Satrapi se jako divila svom stricu, a on je zauzvrat obožavao nju, tretirajući je više kao kćer nego nećakinju. Kada se vratio u Iran, Anoosh je ponovo uhapšen i osuđen na smrt. Anoushu je noć prije pogubljenja bio dozvoljen samo jedan posjetilac i on je zatražio Satrapi. Njegovo tijelo je sahranjeno u neobelježenoj grobnici u zatvoru.
Iako su je Satrapini roditelji ohrabrivali da bude jake volje i brani svoja prava, postali su zabrinuti za njenu sigurnost. U to vrijeme jedva u tinejdžerskim godinama, upadala je probleme s policijom zbog nepoštovanja kodeksa skromnosti i kupovine muzike koju je režim zabranio.
Nagovorili su je da živi sa porodičnim prijateljem na školovanju u inostranstvu, a 1983. godine stigla je u Beč, da pohađa Lycée Français de Vienne . Ostala je u Beču tokom svojih srednjoškolskih godina, često se selila iz jedne rezidencije u drugu kako su se situacije mijenjale, a ponekad je boravila i kod prijatelja. Na kraju je ostala beskućnica i živjela je na ulici tri mjeseca, sve dok nije hospitalizirana zbog gotovo smrtonosnog napada upale pluća . Nakon oporavka, vratila se u Iran. Studirala je vizuelnu komunikaciju, da bi na kraju stekla magisterij na Islamskom univerzitetu Azad u Teheranu.
Satrapi se udala za Rezu, veterana iransko-iračkog rata , kada je imala 21 godinu, od kojeg se kasnije razvela. Zatim se preselila u Strazbur u Francuskoj. Roditelji su joj rekli da Iran više nije mjesto za nju i ohrabrili je da trajno ostane u Evropi.
Satrapi je udata za Mattiasa Ripu, švedskog državljanina. Žive u Parizu . Osim svog maternjeg jezika, perzijskog , govori francuski, engleski, švedski , njemački i italijanski.
